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拦截对方的短信，对方是否会知道取决于你使用的拦截方式和工具。一般来说，手机自带的拦截功能或第三方软件都会保护用户隐私，对方不会知道短信已被拦截。以下是一些常见的设置方法。
1、手机自带的拦截功能：大多数手机都有内置的短信拦截功能，可以拦截来自特定号码或关键词的短信，使用这种功能时，对方不会知道其短信已被拦截。
2、第三方软件：可以下载一些短信拦截的第三方软件，如腾讯手机管家、网秦等，这些软件可以拦截并屏蔽特定的短信，同时可以设置拦截后的处理方式，如直接删除或分类存放，使用这些软件时，对方也不会知道其短信已被拦截。
如果你使用的是其他特殊的拦截方式，如直接告诉运营商进行拦截或某些特殊的技术手段，对方可能会知道其短信被拦截，但这种情况较为少见，一般不会涉及个人使用的场景。
即使对方不知道短信被拦截，也建议不要随意拦截他人的短信，以免引发不必要的误会或冲突，如有特殊需要，请与对方提前沟通并获得同意。